Giuseppe Martone

Bioinformatic & NGS Data Consultant

Profilo Professionale

Bioinformatico e analista dati specializzato in analisi trascrittomiche e nello sviluppo di pipeline riproducibili e scalabili. Esperto in R, Bash e workflow manager, con esperienza nell'ottimizzazione di infrastrutture HPC e cloud e nell'applicazione di tecniche di machine learning per trasformare dati biomedici in insight azionabili. Collaboro efficacemente con team multidisciplinari per integrare risultati analitici in progetti di ricerca traslazionale.

Esperienze Lavorative

Bioinformatico Senior - NEGEDIA

Pozzuoli | Dic 2022 – Lug 2025

  • Progettazione e gestione dell'architettura cloud aziendale per l'elaborazione di dati NGS
  • Gestione dell'intero workflow trascrittomico (RNA-Seq)
  • Sviluppo di pipeline ad alta riproducibilità per DEG analysis
    • Integrazione di tecnologie avanzate: Oxford Nanopore, MGI STOMICS, NVIDIA Parabricks

Data Studio Manager - TIGEM

Pozzuoli | Nov 2021 – Nov 2022

  • Sviluppo e ottimizzazione di pipeline Nextflow per analisi su larga scala
    • Containerizzazione (Docker/Singularity) e automazione workflow HPC/Cloud Redazione linee guida per riproducibilità e supporto tecnico ai gruppi di ricerca

Sviluppo Modello LSTM - UNIPD

Padova | Lug 2021 – Ago 2021

  • Sviluppo di modello predittivo LSTM per serie temporali cliniche post-operatorie
    • Preprocessing, feature engineering e cross-validation Prototipo deployment per percorsi clinici pilota

Competenze Tecniche

Linguaggi di Programmazione

R, Python, Bash/Shell Scripting

Workflow & Orchestrazione

Nextflow, Docker, Singularity

Cloud & HPC

AWS Batch, Google Cloud Platform, SLURM, RStudio Server

Strumenti NGS

FastQC, MultiQC, Trimmomatic, Fastp, BWA, STAR, Bowtie2, Minimap2, Salmon, Kallisto, GATK, DeepVariant

Tecnologie Avanzate

NVIDIA Parabricks (GPU), MGI STOMICS, Oxford Nanopore PromethION

Istruzione e Formazione

  • Master II livello - Università di Padova
    Machine learning e big data nella medicina di precisione (Nov 2020 – Set 2021)
    • Laurea Magistrale - Università di Torino
    Scienze Biologiche con corsi di Genetica Forense e R (Ott 2017 – Mag 2020) Laurea Triennale - Università della Campania
    Scienze Biologiche e Biotecnologie (Ott 2014 – Mag 2017)

Contatti

Vico Parrocchia, 2 - San Felice a Cancello 81027, Italia
Telefono: +39 348 92 31 570